养殖业保种育种追溯管理系统实现养殖业（育种）群个体编码和系谱连续追溯，无需固定家系，记录简便，根据追溯结果能优化选配组合，进而降低近交水平；本发明操作简单，也适用于其它畜禽资源保种群和育种群个体的编码和系谱追溯，具有很强的实用价值。

牲畜保种场（基因库）采用的家系保种法和养殖业育种企业采用的家系选育法均是通过赋予每个世代个体一定数字范围的翅号，留种时根据养殖业号与家系号对照表，按非近亲交配制度组建新家系进行继代繁殖。上述家系个体编码方法在当代内避开亲缘关系较近个体（全同胞或半同胞）交配比较容易实现，然而要对个体（间）亲缘关系进行多个世代的连续追溯，准确计算出个体近交系数和个体间亲缘关系系数则很难执行，尤其是家系数量较多时（一般要求牲畜保种群/育种群家系数量不少于30个，牲畜300个以上）工作量大、操作复杂、错误率高，难以确定交配组合，因此养殖业保种场（基因库）和牲畜育种企业一般仅规避保种（育种）群当代内近亲个体（全同胞或半同胞），不做多个世代的连续追溯，这就导致难以有效控制保种（育种）群近交水平的过快增加。目前尚无有效的解决措施。因此，需要建立一种可靠、简单易行的保种（育种）群家系个体牲畜编码和系谱追溯方法，实现个体亲缘关系在世代传递过程中的连续准确追溯。

目的在于提供一种实现个体系谱多个世代连续追溯的编码及计算方法，以达到有效控制保种（育种）群近交水平的过快增加，保证保种和选育效果的一种牲畜保种育种群家系编码追溯方法及其应用。

赋予保种群家系个体编码，编码组建家系个体系谱，编码规则为：

由ABC组成，其中一位代表父本、一位代表母本、一位代表后代，两后代编码对比，如父本、母本的编号均相同，则代表两后代为当代全同胞，如父本、母本其中的一编号相同，则代表当代半同胞，如父本、母本的两编号均不相同，则代表当代无亲缘关系。

所述A、B、C均为数字编码，且至少为两位数字，两后代对比时：相减结果“00”的为当代全同胞，“0X”（其中X代表非0数值）的为当代半同胞，“XX”和“X0”的为当代无亲缘关系。

一种牲畜保种育种群家系编码追溯方法的应用，追溯个体亲缘关系时，编码选用其中的AB，各世代同一水平不同个体组合间父本号、母本号编码数值分别相减，建立亲缘关系矩阵，相减结果“00”的为当代全同胞，“0X”（X代表非0数值）的为当代半同胞，“XX”和“X0”的为当代无亲缘关系；各保种、育种单位根据自身需要，确定追溯的世代数；若只追溯父系亲缘关系或母系亲缘关系，即各世代同一水平不同公牲畜（或母鸡）组合间父本号、母本号编码数值分别相减，建立父系（或母系）亲缘关系矩阵。

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养殖业育种追溯管理系统实现传统育种向大规模商业化的育种的转变，提高育种效率，养殖业育种追溯管理系统平台逐渐开始得到育种行业人员的关注和使用，它凭借自身的多项功能优势，大大简化了育种过程，节约资源，全面提高作物育种的信息化管理水平，加速新品种选育的进程。

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